Bioclipse项目是基于Java的开源可视化平台,用于基于Eclipse富客户端平台(RCP)的化学和生物信息学。它在2009年获得了脚本功能。
与任何RCP应用程序一样,Bioclipse使用插件架构继承Eclipse的基本功能和可视化界面,例如帮助系统,软件更新,首选项,跨平台部署等。通过其插件,Bioclipse提供化学和生物信息学功能,以及可以通过其他可能的专有插件轻松扩展的扩展点,以提供其他功能。
Bioclipse的第一个稳定版本包括一个化学开发工具包(CDK)插件,用于提供化学信息后端,一个用于分子三维可视化的Jmol插件,以及一个用于序列分析的BioJava插件。最近,R平台使用了StatET和OpenTox。
Bioclipse是由瑞典乌普萨拉大学药物生物科学部的Proteochemometric Group,欧洲生物信息学研究所的Christoph Steinbeck集团和莱顿大学的分析化学部门合作开发的,但也包括其他学术机构开发的扩展,包括卡罗林斯卡学院和马斯特里赫特大学。该开发得到了国际生物芯片协会的支持。
Source Link (en): https://en.wikipedia.org/wiki/Bioclipse